三都澳以其独特的景致、秀美的风姿闻名遐迩，素有“海上明珠”之称。澳内有许多形态各异的礁石岸坞，如“金龟驮珠”“鲲鹏展翅”“烈马回首”“非洲大象”“鸡笼屿”“古猿人”“笔架山”等栩栩如生。峰奇石怪，景色优美，每年吸引众多游人前去观光。三都澳旅游区景点多集中在三都澳东南部，可分为斗姥景区、福海关遗址景区、青山景区、笔架山景区和鸡公山景区五个部分，此外，还有海上渔城全国农业旅游示范点，三都港观赏和海上景观游赏等三大游览点。

　　斗姥风景区坐落于三都澳斗帽岛，荟萃三都澳美景，岛上奇石遍布，有名扬海内的中国沿海一大奇观——螺壳岩。螺壳岩位于斗帽岛东部海滨，是一个附着于倾斜度达60多度石壁上的独立象形岩石，因为酷似螺壳而得名螺壳岩。螺壳岩长6.5米，螺头高3米，全高6米，宽3米，周长15米。螺壳岩是一个空心岩石，内腹空间最高处1.2米，最长3米，最宽处1.5米，可同时容纳7至8人。螺壳岩头大而圆，尾小而略带螺旋状，内腹空心开口于螺壳尾部，口高约1米，是迄今发现的最大、最像、最奇特的空心象形螺壳石。

　　在斗帽山右侧的山坳里由许多石头组成的磹厝，颇像一个迷宫洞，是三都澳斗帽一大奇观。这磹厝，是由山坳两旁山上滚下的巨石自然堆砌而成的，因此洞内乱石嶙峋，蜿蜒曲折，沿洞而下，涨潮时可下到洞半腰，而退潮时可直达海底。

　　斗姥风景区还有斗姥石城、犀牛望月、“福、禄、寿、喜、财”人生五愿景等景点，个个鬼斧神工，惟妙惟肖。凿于悬崖绝壁上的海滨栈道，是一处赏海绝境。斗帽岛还是斗姥娘娘的圣地，那里有许多古老而神奇的传说，让游客仿佛置身神话般的世界。

　　青山岛虾荡尾东侧，有一石壁临海兀立，岩石石纹隐隐显出关云长骑马持刀的雄姿，三都澳笔架山阴霾雨雾时，由于水气折射，形象更加清晰，俗称“仙人画”。

　　三都澳笔架山位于三都澳城澳半岛，因山峰奇雄秀伟，断裂凹凸形如笔架故名。山呈五峰内顾，又被称为“五马峰”。以其雄奇孤峙海上，还被古代诗人赞为“江南第一峰”。相传宋代道教南五祖白玉蟾曾修炼于此。

　　三都澳人工养殖区是浮在海面上的城市，渔户相连，绵延数十公里，被称为“东方威尼斯”。海上人工养殖景观区，用塑料泡沫浮球和木板搭建，下为网箱养殖，上面可以住人，居住8000多人。海城之内有街巷、门牌，有社区管理机构、警察、移动通信营业厅，有百货批发部、酒楼、卡拉OK厅等，这是最独特的海上社区。坐在随波荡漾的渔排上，可以把酒临风、品尝即捞即烹的海中奇珍，还可以垂钓、赏鱼、娱乐休闲，奇趣天成，妙不可言。2004年被国家旅游局命名为“全国农业旅游示范点”。

　　三沙湾内的官井洋，历史上就是大黄鱼的天然繁殖场，每到春夏之交，大黄鱼成群结队回游官井洋，成为中国十分知名的闽东渔场。官井洋是福建省政府颁布的全国唯一的、也是世界唯一的大黄鱼繁殖自然保护区。游人可在此观海、赏鱼、垂钓和品尝海鲜，其乐融融，令人陶醉。

　　三都澳福海关税务司，为晚清西洋风格建筑，砖木混凝土结构，占地面积600平方米，进深30米，面阔20米，高15米，双层正方脊顶三都澳福海关遗址，拱形门窗。满清政府为还甲午战争借款，主动开放三都澳，其福海关税务司由英国人直接掌管。1992年公布为县级文物保护单位。

　　天主教堂，始建于1932年(民国21年)，由梵蒂冈罗马教廷拨款修建。坐西向东，高15米，正面三间宽17米，深三间21米。大门正上方树十字架，下书“天主堂”三字，中层为梅花形圆窗。石木钢筋混凝土混合结构，人字形屋架，檩椽木构，天篷穹窿式，左右两侧共12窗，后厅四方顶，大门两侧置抱鼓石一对，建筑面积600平方米，为15世纪文艺复兴时期西班牙哥特式建筑风格。1996年重新装修。教堂右侧有聚教楼一栋，为神职人员住处。

　　修道院，位于天主教堂后侧，为城堡式结构，四周为围墙与房间，中间为露天花园，保存完好，为三都教堂修女居所。修道院始建于1891年(清光绪十七年)，1934年西班牙籍主教赵炳文重修。砖木混凝土结构，西班牙歌特式建筑。占地面积1750平方米，高18米，有三层。至今，虽历经岁月风雨却依然闪耀着人文光华。

　　三都澳的地貌景观和地质遗迹总体保持良好的自然状态，这些遗迹保存完整、内容丰富多彩，基本未受人为破坏和改变。而区域内丰富的人文景观更是独具风韵，内涵丰富。2018年3月，三都澳获列国土资源部公布的“第八批国家地质公园”。此前，在2015年由国家海洋局等单位开展的“美丽海岛”评选活动中，享有“海上天湖”“东方威尼斯”之称的三都岛，荣获中国“十大美丽海岛”美誉。